Пусть у меня каждый день есть значение прибылей и убытков по позиции.
На каждый день есть значение задействованных средств, к примеру ГО.

Прибыли и убытки и ГО каждый день меняются.

Мне нужно построить график доходности портфеля за период с учетом задействованных средств.
Как это принято считать?

Если Вас именно это интересует, то и стройте график доходности к ГО, но обычно конечно доходность считают к общему размеру собственных средств.

Спасибо, разобралась.